شهرستان مراغه با داشتن 12 دانشگاه، مرکز آموزش عالی و دانشکده، دومین قطب دانشگاهی در آذربایجان شرقی است.
به گزارش خبرگزاری صدا و سیما، در دانشگاه های این شهرستان نزدیک به 13 هزار دانشجو در مقاطع مختلف کاردانی تا دکترا تحصیل می کنند.
پس از پیروزی انقلاب اسلامی و در سال 64 دانشگاه آزاد به عنوان نخستین دانشگاه، فعالیت علمی و آموزشی خود را در این شهر آغاز کرده است.
دانشگاه مراغه هم با عنوان دانشکده کشاورزی از سال 67 در این شهر پا گرفته است.
دانشکده علوم قرآنی مراغه هم تنها دانشکده علوم و معارف اسلامی در آذربایجان شرقی است.
تنها مرکز تحقیقات نجوم و اختر فیزیک کشور هم در مراغه فعالیت آموزشی و تحقیقاتی دارد.
دانشکده علوم پزشکی مراغه هم به عنوان جوان ترین دانشکده در زمینه تربیت پیراپزشک فعالیت دارد.
مجموع این مراکز علمی موجب شده است پس از تبریز، مراغه دومین قطب دانشگاهی استان شناخته شود.