تاسیس و توسعه معادن در منطقه طرقرود نطنز، آسایش و آسانی را از اهالی منطقه سلب کرده است.
طبیعت زیبای نطنز و از جمله منطقه حفاظت شده کرکس زیر تیغ معادن حال خوشی ندارد؛ وجود بیش از ۶۰ معدن سنگ گرانیت و تراورتن که ۲۴ معدن آن در قلب منطقه حفاظت شده و زیستگاه حیات وحش است با برداشتهای بی رویه از این معادن خسارتهای زیادی بر عرصههای زیست محیطی، منابع آبی و تنوع زیستی منطقه بر جا گذاشته است.
معادن سالهاست که به جان کرکس افتاده اند و به رغم اعتراضاتِ مردم نطنز و کاشان به ویرانی طبیعت ادامه میدهند.
از صدای مهیب انفجار و تکه تکه شدن دل کوه و رفت و آمد خودروهای غول پیکر حامل سنگ گرفته تا تجاوز به حریم باغها، مزارع کشاورزی، مناطق مسکونی شهری و روستایی، انباشت نخالهها و باطلههای معدنی در مسیلها و قناتها و آلودگی آب تا انتشار ریزگردها، زندگی و سلامتی مردم نطنز و حیات گونههای جانوری و گیاهی منطقه را تهدید و نابود میکند.
فعالیت برخی معادن از دهه ۶۰ بدون استعلام از محیط زیست ادامه داشته و برای بهره برداران معادن شهرهای طرقرود، اوره و کمجان نطنز ۳۵ برابر حد مجاز، پروانه صادر شده است.