بنیاد ملی علم ایران با هدف اجرای برنامه‌های هدفمند پژوهشی، ایجاد جریان ملی ترویج علم، و همکاری‌های بین‌المللی جایگزین صندوق حمایت از پژوهشگران و فناوران می‌شود.
در این ستاد مقرر شد که «بنیاد ملی علم ایران» جایگزین صندوق حمایت از پژوهشگران شود تا این بنیاد بتواند در حوزه پژوهش‌های پایه و کاربردی و بخش‌هایی که کشور خلاهای جدی دارد یا متولی آن به شکل شفاف مشخص نیست، فعالیت کند این بنیاد قرار است توسعه نظام‌مند علوم پایه و علوم انسانی را نیز در اولویت خود قرار دهد.
در ستاد نقشه جامع علمی کشور با کلیات ایجاد بنیاد ملی علم ایران موافقت و تصویب و نیز مقرر شد که اساس نامه در دو هفته نهایی و در جلسه بعدی ستاد نقشه بررسی شود. در صورت تصویب در جلسه آینده این طرح برای تصویب نهایی در صحن علنی شورا مطرح شود.