زمان نوشیدن چای سبز مهم است، زیرا گاهی اوقات نوشیدن آن بیشتر از آنکه مفید باشد، مضر است.
همچنین هنگام بیدار شدن از خواب، نباید چای سبز مصرف شود، زیرا آنتی اکسیدان قوی و بولیفینول موجود در چای سبز اسید معده را افزایش می‌دهد که این حالت ممکن است باعث ناراحتی معده شود.
از سوی دیگر بلافاصله پس از استفاده دارو، نباید چای سبز مصرف کرد، زیرا خوردن دارو همراه یا پس از نوشیدن چای سبز، زیان دارد و ترکیب مواد شیمیایی موجود در دارو‌ها با چای سبز موجب ترش کردن می‌شود و بهتر است دارو فقط با آب میل شود.
همچنین چای سبز به فرآیند هضم غذا کمک می‌کند، اما اگر همراه غذا یا بلافاصله پس از آن چای سبز نوشیده شود مانع جذب عناصر غذایی برای بدن می‌شود و در درازمدت منجر به کمبود بسیاری از مواد مغذی و مورد نیاز در بدن خواهد شد، در نتیجه توصیه می‌شود دستکم بین وعده غذایی و نوشیدن چای سبز فاصله انداخته شود.