مغانسر به علت واقع شدن در حاشیه رودخانه ارس از ظرفیت بالایی برای پرورش ماهی برخوردار است برداشت ماهی چند وقتیست در این بخش آغاز شده است.
به گزارش خبرگزاری صدا و سیمای مرکز اردبیل، بخش مغانسر با دارا بودن 58 هکتار مزرعه پرورش ماهی , بزرگترین مرکز پرورش ماهی در شمالغرب کشور است.
موقعيت آبي و خاكي ، رودخانه دائمي ، حوضچه ها ، تالاب ها ، درياچه هاي موجود منطقه زمينه خوبي براي آبزي پروري در اين منطقه ايجاد كرده است.