بنابر اعلام سازمان ملی پرورش استعدادهای درخشان، مرحله دوم سیزدهمین المپیاد دانش‌آموزی نانو در قالب آزمون تستی و تشریحی و به صورت حضوری در ساعت ۱۴ روز سه‌شنبه ۲۰ اردیبهشت سال جاری برگزار می‌شود.
در این مرحله از آزمون، شرکت‌کنندگان در ۱۲۰ دقیقه، با پاسخ به ٢٠ سوال تستی و ۶ سوال تشریحی به رقابت خواهند پرداخت
این مرحله در سراسر کشور با حضور ۶۸۴ دانش‌آموز پایه دهم تا دوازدهم برگزار می‌شود و در نهایت، ۴۰ نفر از برگزیدگان در مرحله نهایی که به صورت عملی و حضوری در یکی از مراکز علمی و تحقیقاتی کشور برگزار می‌شود، برای کسب مدال طلا، نقره و برنز شرکت خواهند کرد.