آخرین بررسی و تجزیه و تحلیل مدارک علمی جهاددانشگاهی در نمایه بین‌المللی اسکوپوس (Scopus) نشان می‌دهد، از سال ۱۹۹۹ تاکنون همواره میزان انتشار مدارک علمی و استناددهی به مقالات پژوهشگران جهاددانشگاهی روند افزایشی داشته است.
همچنین بیشترین میانگین استناد به هر سند جهاددانشگاهی به ترتیب مربوط به حوزه‌های موضوعی مهندسی، پزشکی، کشاورزی و علوم اجتماعی است که در همه این حوزه‌ها میانگین استناد به هر سند جهاددانشگاهی از میانگین کشوری بالاتر بوده است و میانگین میزان هم‌تألیفی بین‌المللی محققان جهاددانشگاهی نیز نزدیک به ۱۸ واحد بیشتر از میانگین کشور است.