مربی تیم ملی هندبال امید هدایت سپاهان نوین را بر عهده گرفت.
مرتجی ۱۸ سال پیراهن تیم ملی را بر تن داشت و سوابقی از جمله مدرس فدراسیون هندبال، رئیس کمیته مربیان هیات هندبال استان اصفهان و عضویت در کمیته آموزش فدراسیون هندبال را در کارنامه پر افتخار خود دارد.
وی از سال ۱۳۸۱ به مدت ۱۹ سال مربی تیم ملی در رده‌های نوجوانان، جوانان، امید و بزرگسالان بود.
شهداد مرتجی سابقه مربیگری در تیم‌های سپاهان اصفهان، سپاهان نوین، ذوب آهن اصفهان، شهرداری اصفهان، منیزیوم فردوس خراسان، سنگ آهن بافق یزد، صنام تهران، پرسپولیس و دانشگاه آزاد تهران را در سوابق ورزشی خود دارد.
وی که دارای مدرک مربیگری A جهانی است هم اکنون هدایت تیم ملی امید را نیز بر عهده دارد.