حوزه علمیه مشکات از بین فارغ التحصیلان دانشگاهی، طلبه می پذیرد.
اجرای طرح تحول نظام تعلیم و تربیت، کاهش دوره تحصیلی و اهتمام ویژه به قرآن کریم و حدیث از مزایای برنامه آموزشی در این مرکز حوزوی است.
حوزه علمیه مشکات با هدف تحقق رهنمود های رهبر معظم انقلاب و تحول در نظام حوزه های علمیه تاسیس شده و دارای چندین مدرسه علمیه در شهرهای تهران،قم، اصفهان و کرمانشاه است.