مسجد سید اصفهان به علت دارا بودن تزئینات بسیار زیبای گل و بوته و اسلیمی و وجود خط بنایی و خطوط دیگر از استادان معروف دوره قاجاریه در شمار یکی از شاهکارهای معماری عصر قاجاریه و در خور توجه و مطالعه است.
به گزارش گروه عکس خبرگزاری صدا و سیما: زمینی در زمان سلطان حسین صفوی و توسط وزیر او خریداری شده بود تا در آن مسجدی بنا کنند ولی به خاطر حمله مغول مسجد بنا نشد تا اینکه بعدها سید محمدباقر شفتی مسجد را ساخت و به نام او به مسجدسید اصفهان معروف شد.از آنجایی که در قدیم مساجد محل تحصیل علوم دینی بوده است، مسجد سید اصفهان 45 حجره برای طلاب نیز دارد.در ضلع جنوبی ایوان اصلی و در پشت آن شبستان های ستون دار قرار دارد. تالار تدریس حجت الاسلام شفتی، از آثار در خور توجه و گمنام مسجد است که در محل آن را به چهل ستون مسجد می‌شناسند.در ساخت این بنا از چهل ستون ایده گرفته شده است ولی ستون های کمتری دارد.سقف زیبای مقرنس کاری بر ۹ ستون استوار است.جنس ستون‌ها چوبی و دارای درها و پنجره‌های ارسی زیبایی است.این ایوان باشکوه و این تالار تدریس جوری در معماری بنا جا داده شده که از نظر ، بازدید کنندگان مسجد پنهان است .