شرکت‌های دانش بنیان خوش حساب بر اساس تفاهم نامه بین معاونت علمی و فناوری ریاست جمهوری و سازمان تامین اجتماعی از بخشودگی جریمه‌های قانون تأمین اجتماعی برخوردار می‌شوند
.
بر این اساس به غیر از مزایای پیشین، تمام یا قسمتی از جریمه‌های مقرر در قانون تامین اجتماعی نیز بخشیده می‌شود، این جریمه‌ها بنا به درخواست کارفرما و با توجه به دلایل ابراز شده ای مانند خارج از اختیار بودن و انجام نشدن تکالیف مقرر و با در نظر گرفتن سوابق گذشته و خوش حسابی شرکت ها در صورت موافقت سازمان تامین اجتماعی، شامل بخشودگی می شوند.
این بخشودگی بر اساس بندهای ذیل ماده ۲ قانون اصلاح قانون تامین اجتماعی مصوب مجمع تشخیص مصلحت نظام، انجام می شود، آیین نامه اجرایی این ماده توسط وزارت تعاون، کار و رفاه اجتماعی تهیه و ظرف مدت ۲ ماه پس از لازم الاجرا شدن این قانون به تصویب هیات وزیران می‌رسد.
پیش از این بر اساس تفاهم نامه امضا شده میان معاون علمی و فناوری رئیس جمهوری و رئیس سازمان تامین اجتماعی، این سازمان سعی کرد تا فعالیت شرکت های دانش بنیان و صنایع نرم و خلاق را در حوزه کاری تامین اجتماعی تسهیل کند.
سلسله جلساتی نیز برای هماهنگی بیشتر میان مدیران این دو سازمان برگزار شده است ، مدیرعامل سازمان تأمین اجتماعی در جلسه با دبیر ستاد فرهنگ سازی اقتصاد دانش بنیان و توسعه صنایع خلاق و نرم، با اشاره به برخی مسائل مطرح شده از سوی جوانان فعال در حوزه کسب و کار‌ها، گفت: بخشی از مسائل مطرح شده با اصلاح رویه‌های اداری و به سادگی قابل اجراست، مسایلی همچون دفتر مشترک را می توانیم با همکاری مشترک حل کنیم.
وی اظهار داشت: تلاش دارد برای ارائه خدمات به فعالان حوزه کسب و کارهای نو، انعطاف داشته باشد و جایی که اختیار قانونی دارد می‌تواند به سرعت عمل کند.